平菇菌袋发菌过程中出现严重的杂菌侵染，特别是绿霉菌、镰孢酶占多数，主要原因与防治方法如下：
(1)培养料受潮污染
新鲜、干燥、贮存管理好的培养料，含病害数量相对较少，适宜生料栽培；但贮存期限较长，受潮结块的培养料，含病害数量会比较多，若未经杀毒处理，直接用于生料栽培，则极易造成杂菌污染。
若培养料有结块受潮现象，应做发酵处理或熟料栽培，在培养料中拌入克霉灵、菌绝杀等食用菌专用杀菌剂，生石灰加入量可为3%-6%。
(2)栽培种带杂菌
平菇菌种应发满菌立即使用，否则，会因菌龄过长形成很厚的老化菌皮，或遇到低温导致种袋大量出菇，以上两种都应属于老化菌种。使用了这些老化菌种，菌丝萌发慢，菌丝抗污染能力差，杂菌污染率肯定会高于低龄菌种。
因此，菇农朋友们购买栽培种时，一定要从食用菌正规菌种场预定购买适龄菌种，以免造成损失。
(3)菌种质量差
有的菇农只图价格便宜，不顾菌种质量，购买了质量差的菌种。这种菌种萌发后菌丝稀疏，色泽发灰，菌丝长好后培养料不易接块。这种菌种分解能力差，抗杂能力很弱，因此，接种后也很容易遭受杂菌污染。
(4)发菌管理不当
平菇菌丝适宜发菌温度在20～32℃，高于35℃则菌丝停止生长，应及时倒垛，严防烧堆。温度高于40℃则菌丝很快会死亡，鬼伞等杂菌就会大量发生。但发菌温度并不是越低越好，一定要适度，若温度低于15℃，平菇菌丝生长很慢，而绿霉菌等杂菌的发生几率高。
