生活在土壤中的生物包括动物、植物和微生物。土壤生物的类群、数量一般常随它们相适应的植物而发生变化，土壤的温度、湿度、通气状况和酸度等环境因子对它们的分布也具有明显影响。
1、土壤动物
每公顷的土壤中约含有几百千克的各类动物，其中占优势的类群是蚯蚓、线虫、昆虫、蚂蚁、蜗牛等。
这些动物以其他动物的排泄物、植物以及无生命的物质作为食料，在土壤中打洞挖槽搬运大量的土壤物质，改善了土壤的通气、排水和土壤结构性状，与此同时，还将作物残茬和森林枝叶浸软嚼碎，并以一种较易为土壤微生物利用的形态排出体外。
此外，随着这些土壤动物的活动，浸软了的残落物连同一些微生物一起被传递到土体的各个角落中去。
2、土壤植物
主要所指的是高等植物的地下部分，其范畴涵盖了植物的根系、地下的块茎以及球茎等等。它们于土壤之中发挥着至关重要的作用，不仅能够稳固植物的根基，还可以汲取养分以及水分。与此同时，它们还与土壤中的微生物以及动物构筑起了繁复的生态关系。
3、土壤微生物
土壤微生物包括细茵、真菌、放线菌、藻类和原生动物等五个类群。其中，细菌数量最多，放线菌、真菌次之，藻类和原生动物数量最少。
土壤微生物的种类和数量是土壤环境条件的综合反应。气候变化、土壤性质、植被和农业利用不同，给予微生物生长发育的条件各异，使土壤微生物区系的组成部分、生物量和活动强度等都有很大差异。
