预防畜禽饲养场疾病的一项关键重要措施是生物安全措施，例如防止外来人员的进入，防止野生动物的进入；严格限制参观；饲养人员进入场地时必须进行消毒；不携带生熟肉类进入场地；消灭蚊蝇、老鼠和昆虫；控制鸟类进入棚舍等等。
这些措施的目的在于降低或者阻止传染性病原微生物通过环境或者媒介对畜禽的侵袭。所以，畜禽饲养场是不能够有各种动物混养的，动物饲养场之间也应当保持一定的距离，不能毗邻相连，这都是为了预防共患的传染性病原微生物在畜禽以及动物之间相互侵袭。何况不同品种的鸡有着众多共同的病原微生物，它们之间能够相互感染、传播，所以肉鸡场内是不能够同时开办蛋鸡场的，也不能够养殖其他的畜禽。综合起来，主要有以下几个方面的原因：
一、肉鸡和蛋鸡存在共同的病原微生物。这些病原微生物，像是病毒病当中的马立克病病毒、新城疫病毒、传染性法氏囊病毒、传染性支气管炎病毒、传染性喉气管炎病毒和禽流感病毒等等；细菌病当中的致病性大肠杆菌、沙门菌、巴氏杆菌、衣原体等等；寄生虫病当中的鸡蛔虫、住白细胞虫、疥螨等等，能够在饲养场通过空气、水、土壤、人、虫媒、工具等在两种鸡之间互相传播，从而导致疾病的发生。
二、肉鸡和蛋鸡都可能成为病原（包括弱毒）的保存者、排毒者或者相互传播者。一般蛋鸡场的雏鸡、青年鸡和产蛋鸡是分开在不同的区域进行饲养，实行全进全出，彼此互不混养，其目的是防止鸡之间的疾病相互传播。比如马立克病病毒是长期存在于鸡体内的，产蛋鸡在产蛋的8-12个月会不停地向外排毒，侵袭易感鸡只。如果肉鸡混养在其中，也会像刚出壳还没有注射该疫苗的蛋鸡的雏鸡、青年鸡一样被感染从而致病。
三、长期存在于环境当中的病原和弱毒疫苗毒会对鸡的抗体水平产生影响，导致鸡群免疫失败。
四、容易使得病原病毒的毒力返强或者增强，引发疾病的暴发。肉鸡一般的饲养时间在100天左右，而蛋鸡整个的饲养期为1.5年左右，蛋鸡往往会成为传染源，其病原会不断地传递给不同批次的肉鸡，肉鸡感染或者发病之后又会再次感染蛋鸡，这样反复在一个场内传播—发病—传染—传播，会逐渐使得病原、包括弱毒株从适应到增强毒力，形成强毒，对鸡的致病力更强，甚至引起鸡场疾病的暴发。
