由于双季稻生育期相对较短，穗型较小，因此宜选择行距为25cm的高速乘坐式插秧机进行机插。行距过大的插秧机易导致穗数不足，影响水稻产量的提高。
一、双季稻机插时的基本苗数
为了保证双季优质稻的基本苗，一般早稻栽插行距25cm，株距13cm左右，杂交稻每穴栽3-4株苗，常规稻每穴栽5-6株苗；晚稻栽插行距25cm，株距14cm左右，杂交稻每穴栽2～3株苗，常规稻每穴栽4～5株苗。
二、双季稻机插育苗的水分管理
采用大型拱棚集中育秧的，摆盘前保持秧板湿润，摆盘后灌一次水，使秧板与秧盘内床土湿润，然后将水排干，之后保持盘土湿润，如盘土发白、秧苗卷叶、早晨叶尖无水珠，应及时灌水或喷水保湿。
采用露地湿润育秧的，播后灌平沟水湿润秧板后排干，并保持秧畦湿润，晴好天气灌半沟水，阴雨天气排干水，大风暴雨等恶劣天气需灌水护苗，风雨过后及时排水，施肥、喷药时灌平沟水。
三、双季稻机插育苗期的施肥和化控
采用基质育苗的原则上不需要施肥。对于其他育苗方式或基质育苗条件下叶色褪淡的秧苗，可在移栽前3-5天施一次送嫁肥，667m²用尿素3-5kg兑水500kg于傍晚洒施，施后洒清水进行洗苗，以防伤苗。基质中不含化控剂且秧龄预计超过15天的晚稻秧苗，宜在1叶1心期667m²用15%多效唑75-100g兑水50kg喷施控苗。
四、双季稻机插育苗期的病虫害防治
早稻苗期重点防治立枯病、恶苗病、绵腐病等。播种前可用咪鲜胺等药剂进行浸种消毒，防止种传病害。采用旱地土育秧的，可在播种前667m²用65%敌克松与水配制成1：1000的药液均匀喷雾消毒。晚稻苗期重点防治苗瘟、稻蓟马、灰飞虱、螟虫等。
