倘若多种球虫混合感染，那么肠管会变得粗大，肠黏膜上会有大量的出血点，肠管中会有大量掺杂着脱落肠上皮细胞的紫黑色血液。需要根据临床症状、流行特点、病理剖检情况以及病原检查结果进行综合判断。在鸡生前通过饱和盐水漂浮法或者粪便涂片查到球虫卵囊，或者在鸡死后取肠黏膜触片或者刮取肠黏膜涂片，查到裂殖体、裂殖子或者配子体，就能够确诊为球虫感染。
①加强饲养管理：务必保持鸡舍干燥、通风良好，并保证鸡场的卫生状况，定期清理粪便，进行堆放发酵以杀灭卵囊。
②免疫预防：在世界范围内，已经注册的球虫疫苗有 4 种。在生产过程中使用球虫疫苗时，必须考虑应当使用多价疫苗，以此来获得全面的保护。
③药物防治：不少国家将抗虫药物作为饲料添加剂来加以使用，建议在临床上交替使用不同的药物，以减少抗药性。
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