辣椒播种前或定植前施入田间的肥料为基肥。辣椒施用基肥，要选择合适的肥料种类、合理施肥量、施肥时机以及施肥方法，以确保辣椒生长初期有足够的养分供应，为后续的生长打下坚实的基础。
辣椒基肥应以有机肥为主，混拌适量的化肥，可以选用植物残体或土杂肥等有机肥和矿质磷肥、草木灰等作基肥。施用过程中要注意以下问题：
(1)施肥时机的选择
在辣椒移栽前进行基肥的施用，确保土壤中有足够的养分供辣椒生长初期使用。基肥的70%应在整地前撒施，剩余的40%在定植时沟施。
(2)要防止造成肥料浓度障碍
如果用过量的化肥作基肥，可能造成局部以外的肥料高浓度障碍。有机肥为缓效肥，缓冲性大，即使大量施用，也很少发生浓度障碍，因此蔬菜基肥施用总量不足时，只能通过增加有机肥的数量来满足。
(3)基肥中的氮素化肥少用硝态和铵态氮化肥
硝态氮化肥施入土壤不易被土壤吸附，易灌溉淋失，故不宜大量作基肥。铵态氮肥施得太多，会发生严重的生长障碍，出现叶色黄化或萎缩现象，故不宜大量作基肥，因此，应该用有机氮肥。
(4)磷肥应全部作基肥
辣椒需要磷肥的时期是在生育初期，如果苗期磷肥不足，即使后期追施大量的磷肥，产量还会降低，所以磷肥一般全作基肥。
(5)施肥要准确合理
不同的地质、苗情、季节，施肥种类，施肥方法要有所不同。基肥的施用量应根据土壤肥力条件和辣椒产量目标来确定。
一般而言，亩产5000公斤的情况下，建议施用腐熟有机肥5000～8000公斤，并掺入适量的无机肥料如过磷酸钙和硫酸钾。
