立秋后，天气渐凉，正是适宜韭菜生长的季节。此期应加强肥水管理，养护好韭菜的根系，使其增加营养积累，才能在冬季多出产量，增加效益。
首先，秋季雨水较多，应做好排涝工作，以免土壤水分过大造成韭菜沤根。秋季在无雨的条件下，8月5～7天浇一水，9月7～10天浇一水，保持土壤湿润。10月10天左右浇一水，保持土壤见干见湿。勿浇水过多，以免引起植株贪青旺长致使营养回流延迟。
其次，应加强肥水管理。秋季正是韭菜追肥最适宜的季节，此期内追肥，有利于提高韭菜的营养积累。因此，应抓住有利时机，不能过早也不能过晚，过早施肥容易引起韭菜疯长，降低植株的抗逆能力，再加上正值高温多雨，很容易导致疫病的发生，使韭菜烂了棵子。过晚施肥则会因为温度的逐渐降低而使韭菜不能积累足够的营养。一般在“立秋”后10天内追施最为适宜。
追肥时可亩施复合肥15～20千克，饼肥300～350千克，每15天追复合肥一次，共追2～3次。每次追肥后应及时浇水，注意浇水量不要过大，切忌大水漫灌。浇水后及时中耕，以增加土壤的透气性，促进韭菜根系的生长发育。为增强韭菜的生长势，此期内可喷100毫克／升的芸薹素内酯一次，以促进叶片生长。
秋季仍须防止韭菜倒伏。韭菜倒伏后，常造成韭叶腐烂，诱发疫病，造成假茎、叶片死亡。因此，应采取有效措施，防止韭菜倒伏。一般菜农为防止韭菜倒伏，大都提前在夏季普遍采用木桩拉绳扶持韭叶防倒伏的方法，效果较好。若在秋季仍倒伏，要注意加密拉绳间距。另外，还要注意施氮肥勿过量，并注意浇水不要过多过勤，以免引起韭菜徒长。
另外，要想养护好韭菜的根系，防好病虫害也是一项重要的措施。韭菜秋季易发生的病害主要有疫病和白绢病，应及时喷施525%抑快净1500倍液、20%的甲基立枯磷1000倍液防治。害虫主要有韭蛆、蛴螬、金针虫等，可用48%乐斯本乳油灌根防治，防治效果可达94%以上，一般每亩用药400～500毫升，兑水500千克，用水壶或喷雾器去掉喷头顺垄浇灌。如果结合来年春季用防虫网防韭蛆，则无农药韭菜生产就可以实现了。
