大棚苦瓜连作障碍发生的原因主要包括土壤病虫害积累、土壤化学性质变差、土壤酸化加重等，这些因素共同作用，导致大棚苦瓜连作障碍的发生。
一、大棚苦瓜连作障碍的发生原因
①病虫危害加重。由于温室、大棚菜地难以实行有效的轮作，导致病菌、虫源大量积累，容易加剧病虫害的发生。
②土壤化学性质变差。由于施用大量的化肥，尤其是氮肥，土壤又得不到雨水的淋洗，加之浅耕、土表施肥﹑排灌系统不配套等栽培措施不当，导致土壤产生盐分积累。
③土壤酸化加重。多年来有机肥施用少，化学氮肥施用量多，尤其是在温室、大棚栽培的特定条件下，很容易导致土壤酸化，影响作物正常生长。
二、大棚苦瓜连作障碍的防治方法
①提倡合理轮作，减轻作物病虫危害及土壤酸化。水旱轮作既可防治土壤病害、草害，又可防治土壤酸化﹑盐化。旱地轮作可以防治或减轻作物的病虫危害，因为危害某种蔬菜的病菌未必危害其他蔬菜。
②增施有机肥。增施有机肥可改善土壤结构，增强保肥、保水﹑供肥、透气、调温功能，增加土壤有机质、氮、磷、钾及微量元素含量，提高土壤肥力和土壤蓄肥性能，减少化肥流失，增强土壤对酸碱的缓冲能力﹐提高难溶性磷酸盐和徵量元素的有效性，还可消除农药残毒和重金属污染，促进光合作用，提高蔬菜品质。
③淹水排盐。采收结束后，应及时清洁田园，并利用夏秋多雨季节揭膜灌水，把浮在水面上的枯枝残叶，落果杂草等捞起集中晒干烧毁，以降低盐分浓度，减少病虫残留。也可以采用深耕的办法降低土壤盐分浓度，一般深翻25厘米左右，将上下土壤对换，并结合灌溉水洗盐，效果更佳。
④合理施用氮、磷、钾肥，实行科学用肥。
⑤调整ph值。根据土壤ph值，采用相应的调整措施，使其逐步达到或接近多数蔬菜所适宜的中性或偏酸性的范围。
⑥施用重茬剂。施用重茬剂，可促进作物根际有益微生物群落大量繁殖，抑制有害菌生长，减轻病菌积累，调节营养失调和酸碱失调，提高根系活力，增强抗性。
