芹菜的叶片可抗-3℃低温，根部不可低于0℃，否则出现冻害，所以对芹菜贮藏的适温为。～3℃，芹菜无保护组织，收后易失水，贮期对湿度要求较高，以空气相对湿度90-95%为宜。要创造这样的贮藏条件，在有冷库的地方是十分容易的事，而对没有冷库的地方来说，则需要采取微冻贮藏的方式。
在吉林省以地下挖沟办法贮藏，沟深要比芹菜株高长20厘米，一般为60-80厘米深，沟宽为80-100厘米，沟长可根据贮量来定。沟的方向以东西延长南北向为宜，沟底要挖一窄沟作通风散热用。
作长期贮藏的芹菜应择实心芹，在轻霜过后采收，收时要从根茎处割下，每l -1.5公斤捆成捆，去掉黄枯病叶，直立于沟内，每平方米可贮100 - 150公斤，待贮藏沟摆满后，在沟上用成捆秫秸覆盖，白天遮光降温，晚上防霜散热，直到沟温下降到-2℃时，再在秫秸上覆土，要分二次覆盖，第一次10-15厘米，第二次再覆15-20厘米，或在其上增加秫秸厚度，另外，也可将此沟挖在柴草堆下，待温度下降沟温低于-2℃时，让柴草起保温作用。
为了观测沟内温度变化，要在芹菜入沟后，作一个三角形的测温筒放在沟的一端的中间，用带绳的棒状温度计测定沟温。贮后沟内温度较高，要注意放风降温，否则叶片变黄是伤热的表现，严重时叶片黄化叶柄腐烂。只要贮期注意看管沟内温度，控制在适温范围内，这种方式可贮到元旦。
