此外，大豆品种对花叶病的抵抗性有明显的差异，感病品种不仅植株受害重，病株率高，产量和品质均受影响。
五、防治方法。根据病毒病原特征及已知流行因素，可采取下列防治措施。
1、种植抗病毒品种：各地大面积推广和改良品种，大多数对大豆花叶病毒有一定抗性，一般均在中抗以上，改良品种在连年种植过程中，发现病毒逐年严重，一是种植品种抗性衰退，或是当地侵染病毒株系的变化引起的，应对改良品种提纯复壮或改种适合当地的抗病品种。
2、建立无毒种子田：侵染大豆的病毒，很多能经大豆种子播种传播，因此种植无毒种子是防治病毒病的重要的有效防治方法，无毒种植田要求种子田100米以内无该病毒的寄主作物（包括大豆）。种子田在苗期去除病株，后期收获前发现少数病株也应拔除，收获种子要求带毒率低于1%。病株率高，或种子带毒率高的种子，不能作为翌年种植种子用。
3、防蚜治蚜：侵染大豆病毒在田间流行主要通过蚜虫传播，传播田间病毒又主要是迁飞的有翅蚜，且多是非持性的传播，因此采取避蚜或驱蚜（即有翅蚜不着落于大豆田）措施比防蚜措施效果好。目前最有效方法是苗期即用银膜覆盖土层，或银膜条间隔插在田间，有驱蚜避蚜作用，可在种子田使用，大豆后期发生蚜虫，应及时喷施杀蚜剂，并应注意几种杀蚜药剂交替使用，防止多次使用一种药剂，使蚜虫产生抗药性。
4、加强种子检疫：侵染大豆的病毒有较多的种传病毒，因此，加强种子检疫尤为重要。我国大豆种植面积大，品种多，种植季节及方式、地理气候条件差异很大，病毒对大豆适应条件众多，利于病毒产生侵染性分化，形成不同毒株。因此，在各地调种或交换品种资源，都会引入非本地病毒或非本地病毒的株系，这种大豆种子引入，必然造成大豆病毒病流行的广泛性及严重性，因此引进种子必需隔离种植，要留无病毒株种子，再作繁殖用，检疫及研究单位要加强检疫病毒病的措施及采取有效的防治措施。
