番茄喜肥又耐肥，番茄生长期间能否保持营养生长和生殖生长协调平衡是施肥的关键。同时，番茄的需肥又是动态的，不是一成不变的，因而在不论基肥还是追肥，必须要有所侧重。
一、基肥要以有机肥为主
基肥要以优质有机肥为主，施足、施好。不仅能改善土壤结构，为番茄生长创造良好的生态环境，更重要的是可缓慢有效地补充土壤中氮、磷、钾和微量元素。番茄幼苗期需肥量虽少，但需全面供应氮、磷、钾等养分，促进根、茎生长和花芽分化。
定植缓苗后到第一、二穗果膨大前所需的养分，基本全靠土壤和基肥养分供应。而有机肥为缓效肥，难以满足其生长需要，因此，基肥还必须配施适量的速效化肥。
二、穴肥要施用生物菌肥
生物菌肥不仅可以抑菌，预防根部病害的发生，而且还能活化土壤、促进生根、调控植株生长。可用激抗菌968、瑞神复合型生物菌肥等，每亩用量100～120千克，定植前均匀施入穴内，并与土拌匀。
三、冲肥要循序渐进
番茄缓苗后生长缓慢，第一穗花陆续开花、坐果，此时营养生长和生殖生长同步进行，所需养分逐渐增加。
当进入结果期后，吸肥量急剧增加。当第一穗果采收、第二穗果膨大、第三穗果形成时，番茄达到需肥高峰期。在以后20天里，吸钾量猛增，其次是磷。结果盛期，养分吸收量达最大值。
结果初期，本着促根促果的原则进行冲肥，以后随着植株需求速效养分数量的增加，可单用芳润进行冲施，促棵膨果，每亩每次5～7.5千克。
四、要合理进行叶面追肥
叶面追肥不仅可以迅速补充番茄生长所需的营养元素，还可以增强植株的抗病抗逆能力，提高果实品质等。缓苗后到开花前喷施含锌叶肥，不仅可预防顶叶发黄，还有助于增强植株对病毒病的抵抗能力。
番茄坐住如绿豆粒大小时，可喷施钙、镁肥，增强果皮硬度，预防脐腐病。结果中后期可喷施磷酸二氢钾+甲壳素，补充营养，协调植株生长，增强植株抗病能力。
