在养鸭过程中若卫生防疫稍有疏忽，往往引起大批发病，甚至死亡。
养鸭必须坚持“预防为主，防重于治，严格消毒，及时治疗”的原则，营造良好的内外环境，确保鸭健康生长发育。
因此，鸭场建立的卫生消毒制度，是非常重要的。以下三点是非常重要的。
①鸭场门口要设独立的消毒池，池内消毒水要定期添加或更换。饲养员和兽医管理人员进出鸭场时要更换工作衣、鞋、帽，并进行相应的洗涤和消毒，在门口消毒通道内要经紫外线消毒或雾化消毒后方可入场。不同楼栋的饲养人员不要相互走动，严格控制外来人员进出养殖场。车辆进场需经门口消毒池消毒处理，车身和底盘等要进行高压喷雾消毒。
②鸭场在全进全出前后都要进行冲洗和消毒工作，在平时饲养过程中还要定期地进行禽舍消毒，在天气暖和时可以带禽消毒。饮用水若采用井水、山泉水或河水，还要在水中添加含氯石灰进行消毒处理。育雏舍、孵化舍、仓库等要熏蒸消毒。装禽袋子、周转蛋架或蛋筐等都要经特定的消毒后才能使用。
③鸭场中若发现病死鸭时要及时通知兽医人员进行检验。经兽医人员检查、登记后，病死鸭要进行无害化处理（如高压灭菌或在远离养殖场的某个特定地方进行深埋、消毒处理），不能随便乱丢。怀疑是烈性传染病的要立即停止解剖，做好场地消毒工作，并立即上报有关部门处理。
