鸡球虫病严重危害养鸡业。得病的鸡既使病愈鸡生长仍然受阻，增重缓慢；成年鸡多为带虫者，但增重和产蛋能力降低。
【症状类似】
(1)坏死性肠炎：突然发病，不食、趴卧，粪便水样稀薄、恶臭，有的混有血液。
(2)鸡组织滴虫病：精神委顿，食欲不振，羽毛松乱，下痢，排含血或全血稀粪。
【病变类似】
(1)坏死性肠炎：病死鸡小肠中后段黏膜坏死是坏死性肠炎的特征病变。
(2)鸡组织滴虫病：盲肠壁增厚和充血，渗出物常发生干酪化，形成干酪样的盲肠肠心（似柱状同心圆），肝脏上大小不等的坏死区是组织滴虫的特征病变。
【混合感染】产气荚膜梭状芽孢杆菌往往随球虫感染乘虚而入，导致坏死性肠炎。免疫抑制病与球虫病并发会引起更严重的疾病。
【免疫失败】各球虫之间有无交叉保护，如不使用多价疫苗免疫很难获得全面的保护。尽量采用致弱虫株，特别是早熟致弱株，既可诱导免疫保护，又可减轻疫苗本身对机体造成的损害。有些鸡场用球虫苗免疫后，引起的副作用很大，严重影响鸡的生长，得不偿失。另外，一种球虫疫苗不宜在一个鸡场长期使用，连续使用2 -3批鸡后，应换用其他疫苗免疫。应严格按照说明操作，接种前后饲料中不得添加抗球虫药，不得使用影响免疫的药物，人为营造适合卵囊生长的环境等。
