发生沤根的番茄，根部开始时表皮显锈褐色，随着症状的加重根系腐烂，用手轻轻就可以连根将植株拔出，可以看到没有新根和不定根.
其实，不用看根，从地上部分也可以在苗期区别沤根现象，刚开始时叶片先萎蔫，再慢慢变黄、焦枯，严重时有可能整个苗床的幼苗叶片成片干枯。
实际生产中，要根据发生沤根的原因采取不同措施。
(1)浇水不当
番茄的育苗多采用穴盘育苗的方式，由于基质透气性强而保水性差，因而需要及时浇水，防止幼苗脱水而出现老化苗。
如果浇水过勤或一次性浇水量过大，就容易造成基质积水而沤根。因此要合理控制浇水量与次数，可用洒水的方法代替大水漫灌苗床，防止穴盘内基质湿度过大。
(2)地温不适或者是肥水不当
要正确调控棚室温度，一般苗期棚内温度控制在25～30℃为好，地温不要低于15℃。同时，要注意合理的肥水管理，做到施肥不过量，浇水少而勤，以防番茄根系受到伤害。
在发生轻微沤根后，要及时提高地温，降低土壤或穴盘基质中的湿度，并叶面喷施爱多收6000倍液混加甲壳素8000倍液，促进幼苗生根，增强幼苗的抗寒抗逆能力，防止沤根，有利于幼苗生根。
