不定根是生长于茎、叶或花等非根部位的根系。在番茄生产中，不定根可以生长在茎、叶或花等不同部位，对提高番茄的生长和产量有着重要的作用。
虽然番茄根系在植株生长和产量方面有着重要的作用，但番茄的根相对比较稳定，不易产生不定根。不过，当番茄受到一定的逆境刺激时，例如营养水分过剩或缺乏、土壤呼吸过强等因素，番茄的根就可能产生不定根。
有时，番茄的不定根非常发达，茎蔓着地即生，茎蔓上生出的不定根能提高番茄对土壤养分的吸收能力，使植株坐果能力强，结出的果个大、周正，畸形果少。因此，养护好番茄的不定根对于促进番茄增产增收效果明显。
(1)番茄落蔓后要先把茎蔓压住的地膜移开，使茎蔓充分与地面接触，促进番茄不定根下扎到地表。
(2)要控制好土壤水分。不定根剐刚生长时要保持地面的湿度适宜，切不可大水漫灌和过度干旱。
(3)要控制好棚内的地温。新生的不定根又白义嫩，地温变化过快常使不定根生长受到伤害。因不定根生长在地表，而地表温度受棚温影响变化最大，尤其是在冬春季节，昼夜温差大，若温度调控不好，地温过高或过低，不定根常会受到伤害。因此，在冬春和深冬季节，棚室一定要加强保温措施，保持地温相对恒定。
