蛋白质饲料对养鱼显得特别重要。目前生产上广泛应用的蛋白质饲料有：植物性饼类，植物性粕类。此外，动物性蛋白质饲料（如鱼粉、肉骨粉、发酵血粉等）也广泛应用。
一、豆饼（粕）类饲料
属植物性蛋白质饲料，蛋白质含量为42%左右。它是饼（粕）中蛋白质品质较好，利用率较高的一种，含有丰富的氨基酸，特别是鱼类所需的赖氨酸和精氨酸含量较高。
生豆饼中含有抗胰蛋白酶、皂角素等有害物质，适当加热以后可将这些有害成分破坏，但加热时温度要适当，一般为140℃～150℃以下加热2分30秒，温度过高会降低豆饼中氨基酸的利用率。
二、棉仁饼、菜籽饼（称为两饼）
也属于植物性蛋白质饲料。其蛋白质含量受油脂加工工艺及去壳情况的影响。去壳榨油后的棉仁粕和菜粕蛋白质含量与豆粕的蛋白质含量接近，但其可利用率低于豆粕。
菜粕中含有多种有毒成分，主要来源于芥苷（可分解成为有毒物质）。目前市场上已有菜粕的解毒剂，如浙江农业大学许梓荣教授研制的6107菜粕解毒剂，可减轻菜粕的毒性。
除上述饼粕以外，还有芝麻饼、花生饼等也可作为鱼饲料中植物性蛋白质的来源。
三、鱼粉类饲料
鱼粉属动物性蛋白质饲料，含有较高的蛋白质，且其中某些必需氨基酸含量丰富。此外，在鱼粉中还有一些未知的促生长因子。因而在饲料中应用鱼粉可显著地起到促进鱼类生长的作用。
鱼粉由低质鱼或鱼品加工副产品制成，属应用广泛的动物性蛋白质饲料。世界上鱼粉的主要生产国是秘鲁、智利和日本。
鱼粉的质量：颜色，黄棕色或黄褐色，具有鱼粉的正常气味，无异臭及焦灼味，能通过2.8毫米标准筛网的比例至少为98%。此外，还有关于盐分、砂分、粗脂肪等方面的要求。
四、肉粉、肉骨粉
肉骨粉是屠宰场在进行肉类加工时的废弃物，包括不能食用的内脏、杂骨、胚胎及经病死的畜禽（消毒）加工而成。肉粉含蛋白质较高，但是其利用率较低，易对其用量造成限制。
