枝霉菌被病是引起平菇棉絮状白色菌丝覆盖床面或菌柄基部软腐的病害，而水霉菌被病是引起平菇桔黄色绢丝状菌丝覆盖床面的病害。前者的病原菌是前述异形葡枝孢霉，而后者的病原菌是鞭毛菌亚门的同孢子绵霉。
(1)为害症状的区别
①枝霉菌被病：培养料表面被病菌浓密的气生菌丝占满，平菇菌丝生长受抑制，床面不出菇或只零星出菇，已成长的子实体菌柄及部分菌褶也长满白色菌丝，颜色暗淡，菌柄基部呈水渍状软腐，稍触动即倒伏。
②水霉菌被病：发病初期培养料面长出白色稀疏的菌丝层，随菌丝层加厚及孢子囊大量形成，颜色由白变成桔黄，菌丝交织成丝网状。用手撕扯有丝绸物感，不易撕开扯断，下面的培养料变黑湿腐，平菇菌丝消失。
(2)发病原因的区别
①枝霉菌被病：病原菌存在于有机质丰富的土壤中或有机物上，利用菜地或苗床种平菇易发生此病，温暖潮湿条件下发病严重，塑料袋种的此病轻或不发生。
②水霉菌被病：病原菌存在于水中或潮湿的有机物上．随水或培养料进入菇床，培养料含水量过高和阴暗潮湿条件下易发此病。
(3)防治方法的区别
①枝霉菌被病：室外露地或阳畦种植时，用0．1%多菌灵拌料，并控制培养料含水量勿过高。
②水霉菌被病：使用清洁水拌料，培养料含水量勿过高，培养室要通风明亮，勿造成阴湿条件。
