4、疾病的预防：工厂化养殖一般是水体小、密度大，疾病预防非常重要，要确保不能有疾病发生，否则容易全军覆没。主要采取以下措施：
a、要选择健康没有疾病史的鱼放入养殖池。
b、在入池之前要进行消毒处理。
c、严格控制水处理工艺过程，在处理系统设置消毒杀菌设备。
d、在养殖过程中注意环境变化对鱼类的胁迫压力。包括各种水质的干扰波动、水温的变化等。胁迫压力大，将使鱼类的抗病能力降低。
e、注意投饵的科学性，避免鱼类过食现象，鱼类过食也增加鱼类负担，容易生病。
f、使用专用工具，并经常消毒。
五、发展工厂化养鱼注意事项
目前，我国对工厂化养殖的研究还远远落后于世界水平，有关理论体系和技术体系还很不完善。工厂化养鱼是高效益、高技术、高投入、高风险的产业，企业有兴趣要发展的话应量力而行，根据自身具体条件，选准养殖对象、养殖设施和开发基地，发挥当地的自然优势和技术优势，对采用的技术路线、生产成本及效益、经营风险等方面进行科学、严谨、客观地分析论证。
1、工厂化养鱼的初期投入较高，因此发展工厂化养鱼的品种选择及前期的调研工作非常重要，投资一定要慎重。
2、相对于传统的养殖方式，工厂化养鱼是新兴事物，技术含量较高，因此养殖企业需要一支高文化高素质、懂技术懂操作的队伍。否则，即使有再好的设施和技术，也只能以失败而告终。
3、相关单位应联合攻关。工厂化养鱼涉及环境、饵料、育种、病害、养殖、工程、机电自动化等学科，是一个综合性的系统工程，单靠企业单兵作战，难以承担经营风险和实现社会效益、企业效益的统－。因此，政府、科研单位应该大力鼓励和支持企业尝试、发展工厂化养殖，就有关技术难题进行联合攻关。
