对虾的鳃位于由头胸甲侧甲及胸部体壁构成的鳃酸中，由第2小颚外肢的摆动使水流经鳃腔，在鳃丝上进行气体交换，吸收氧气，排出二氧化碳，完成呼吸作用。
五、排泄系统
对虾的排泄系统由位于第2触角基部的触角腺组成。触角腺为一囊状腺体，并有复杂的薄壁泡状系统相通，排泄孔开口于第二触角基部。由于排泄物多呈绿色，故触角腺又称绿腺。
六、神经系统
对虾的神经系统由脑及腹神经索组成。对虾的脑由前脑、中脑、后脑三部分组成，位于两眼基部后方，后脑向后发出一神经组成围咽神经环环绕食道，围咽神经环在食道后方与咽下神经节相连并由咽下神经节向后发出腹神经索。
腹神经索由胸部向后延伸，在每一体节形成一神经节。脑及各神经节上发出许多分枝神经进入附肢、眼、胃、肝胰脏等组织、器官中。
七、肌肉系统
对虾肌肉发达，多为横纹肌，分布于头胸部和腹部，以腹部肌肉最为发达。
头胸部的肌肉多与器官的活动有关，如动眼和摆动触角等；腹部肌肉主要与虾的运动有关，通过腹部肌肉的收缩可使对虾迅速弹跳。
八、内分泌系统
对虾的内分泌系统由神经内分泌系统和非神经内分泌系统组成，前者由神经内分泌细胞组成，分泌各种激素并释放入血液中，作用于各种靶器官。
重要的神经内分泌器官之一是x-器官。x-器官位于对虾眼柄中，主要功能为调节对虾蜕皮活动及性腺成熟等生理活动。
非神经内分泌器官是一些腺体组织，分泌激素等物质参与各特定的生理过程，如Y器官可分泌蜕皮激素，促进对虾蜕皮，其活动受x器官分泌物调控。
