(1)光闪株：连阴天后转晴，中午高温，大通风后叶片萎凋，叶肉褪绿，正面呈黄绿色，背面无明显症状。
①发病原因。辣椒根茎木质化程度高，组织细密，水分、养分渗透压小，不耐旱；连阴天期间根系萎缩，放晴后吸收力弱，而光照强度大、温度高使植株水分蒸腾量大，造成植株脱水，引起缺钙、硼、锰、铁等而闪秧。
②防治办法。阴天也应揭开草苫让苗见光。阴天转晴、光照强时盖部分草苫，待植株慢慢适应后，逐渐加大见光量和强度。出现叶凋后，及时遮阳降温，勿开膜通风，先喷清水，后喷多元素营养液。
(2)皱叶症：叶面鲜绿发黄，心叶生长慢，叶缘上卷，叶肉凸起，叶脉下凹、皱缩不平。根木质部变黑，花期延迟，花而不实。
①发病原因。前半夜温度过低(15℃以下)。
②防治办法。白天在叶面上喷700倍的硼砂水溶液或含硼的多元素肥。前半夜室温尽可能提高到20℃，下半夜15℃，使光合产物及营养正常运转，2-3天后叶片即可平展。
(3)落叶落蕾：下部叶脉间黄化，由褐黄色转为米黄色而自落，花蕾和幼果会因营养供应不足而脱落。
①发病原因。磷素是花芽分化的需要的重要元素，早期缺磷会引起花蕾发育不良，导致开花后自落。辣椒在生育初期需钾量少，坐果期增大，并且钾是16种营养元素中最活跃的元素。由于温室辣椒结果期正值低温弱光期，土壤缺钾或供钾不足均会引起落叶、落蕾。
②防治办法。苗期至花蕾期叶面喷施磷酸二氢钾、绿丰宝或光合微肥补充磷、钾元素。
(4)脐腐果：辣椒植株生长点叶尖干焦，果实脐部呈黑膏药状干腐。
①发病原因。钙是辣椒生长中需要量最大的元素，并在16种营养元素中起支配调控作用。土壤中钙素充足，但钙素在植物体内是移动性最差的元素，温度过低、过高或干旱均会引起植抹缺钙。
