为了满足生产的需要，应选品种纯正、发芽率高、发芽势强、饱满、无病虫害、无其它杂质的种子进行育苗。如果所用种子是散装种子，从外观上看，有病虫害，瘪籽、小籽多，色泽灰暗，是质量较差的种子，那么，播种前，就应对所用的种子进行消毒、清选，挑出腐烂、破损、小籽、瘪籽、畸形和有虫蛀的种子。清选包括过筛、风选、拣选和水选等方法。
①干热消毒法。有些种子在干燥时对温度的忍耐力强，如番茄，可用干热法消毒。具体方法是：先将种子放在阳光下充分曝晒．使种子内含水量降到7%以下，然后用70-73℃的温度处理种子4天，即可供播种用。此法可防止番茄溃疡病和病毒病。
②热水烫种法。这种方法可用于表皮比较坚硬的种子，如菠菜、黄瓜、冬瓜、茄子等能耐较高的水温而对种胚的影响不大。方法是：先将种子用冷水浸湿，然后把种子迅速倒入4-5倍的70℃水中，并立即不停地搅拌，边搅拌边浸泡，20分钟左右即可取出，稍晾后供播种或催芽。
③药液消毒法。针对不同品种的病害，用不同药液处理。例如，防治番茄病毒病，可用磷酸三钠溶液或氢氧化钠溶液浸渍。方法是：先将种子用清水浸3-4小时，取出稍晾干后再浸入10%磷酸三钠溶液中，或浸入2%氢氧化钠溶液中，浸溃20分钟，捞出后用清水淘洗干净，防止因碱性过强降低种子发芽率。
④药粉拌种消毒法。用福镁双可湿性粉剂、克菌丹可湿性粉荆、多福可湿性粉剂或百菌清可湿性粉剂拌种可防止猝倒病，一般用药量为种子重量的0.3%。方法是：将种子浸泡完毕（如茄子浸8小时），捞出稍晾去种子表面的水分但又有一定的湿度时，放入粉剂均匀拌种，使每粒种子表面都沾有一层粉剂。拌好的种子即可直接播种，不宜催芽。
