芝麻根系的发育与抗性有非常密切的关系，因为根系是芝麻最主要的吸收器官，芝麻生长发育所需要的水分和养料，绝大部分要靠根系从土壤中吸取，只有根系发育良好，活力强，才能保证其檀株营养的充分供给，使植株生长健壮，增强其对不良环境的抵抗力。这就好像一个人，胃口好，消化力强，身体健壮，一般就不易感病。
为了了解芝麻根系发育与抗性的关系，河南省芝麻研究中心于1979年—1981年选择了抗病耐渍的河南1号和不耐渍、不抗病的驻芝2号两个芝麻品种，比较了两品种根系形态和根系活力的差异。测定的项目包括：
①根系干、鲜重，代表根系发育的好坏。
②根系总表面积和活性表面积，既是根系发育程度的指标，也是根系活力的重要指标。
③根系伤流量，是将芝麻植株从近地面处截断后，搜集从伤口断面流出的液流量，代表根系吸收能力，是根系活力的重要指标。测定结果表明，耐渍、抗病的河南1号芝麻，其根系表面积和伤流量．分别比不耐渍、不抗病的驻芝2号芝麻大15. 6%和20%．其根系干、鲜重则大得更多。这充分说明，耐溃、抗病的芝麻品种之所以耐渍、抗病，是因为其根系比较发达，活力强，在不良的环境下，仍能保持很强的吸收能力。
就同一芝麻品种而言，当栽培条件良好时，有利于芝麻根系的发育，提高了其根系的活力，也增强了芝麻的抗性。因此，为了抗御自然灾害，实现芝麻高产、稳产，我们在选择种植耐涝、抗病、高产芝麻品种的同时，还必须采用相应的先进栽培技术，促进根系发育，提高根系活力，以增强芝麻对旱、涝、病等自然灾害的抵抗力。
