白蚁蛀食木料和茯苓，造成严重减产。防治方法：5～6月间繁殖出巢时，在蚁路上撒农药，使触杀死亡，或者用敌百虫毒土，撒在窖上，进行毒杀；
也可以引进白蚁新天敌——蚀蚁菌，此菌只要蚁群中有一只感染上，能使巢内全部白蚁感染而死亡，而蚀蚁菌对人、畜均无感染力。
茯苓外皮呈黄褐色时即可采收。采收后堆在不通风的屋子里，使其发汗，隔2～3天摊开风干表土水分，再堆放发汗，反复2～3次。
堆放过程中有的茯苓产生鸡皮状的斑点，变黄白色时，应随即剥去，以免引起腐烂。至外皮现皱纹时，用刀剥下皮即“茯苓皮”。然后将茯苓切成均匀的薄片，晒干即可作药用。
近表皮处呈淡棕红色，加工切成块状或片状，称“赤茯苓”。剩余的边角称“茯苓碎”，然后分别晒干入药。
有时茯苓菌核中有穿心树枝或树根，可带枝或根切片晒干后，即是传统中药中的“茯神”。通常100kg鲜茯苓，可加工50～ 55kg茯苓片或块。
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