菇的菌丝体和子实体生长期间，遇到不适宜的环境条件，引起生长发育障碍，产生的各种异常现象。因为其不是由病原微生物侵染所致，故叫非侵染性病害，也叫生理性病害。常见蜘有以下几种：
(1)菌丝徒长。症状：双孢蘑菇、香菇、平菇等出现的菌丝密集成团，结成菌块，或织成菌皮，而不出菇。病因：菇房通气不良，温度过高。薄膜覆盖时间过长，覆土过细，料层内透气不良。一级种转管时，单用气生菌丝转接。
防治方法：子实体分化期，加强菇房通气，降低温度。覆土材料要适宜。对菌块及菌膜，可划破催菇。
(2)菌丝退化。症状：蘑菇在爬菌期间，覆土层的菌丝明显衰退或停止生长。病因：气温突然下降。
防治方法：提高菇房温度。覆盖用35%生石灰水浸泡消毒的稻草或麦秸。旌l号蘑菇健壮素。
(3)菌丝萎缩。蘑菇、平菇、草菇等在发菌或出菇阶段，菌丝变黄、变褐、萎缩死亡。病因：培养料碳氮比不适，或腐熟过度。含水量过高，通气不良，菇房闷热。
防治方法：调好碳氮比，水分要适宜，正确进行堆肥。适期播种，避免高温期为害。对覆土进行灭菌和杀虫处理。
(4)硬开伞。症状：蘑菇子实体未成熟，即提早开伞。病因：温差过大，菌柄与菌盖的生长失去平衡。防治方法：低温来临前，做好菇房保温，同时提高湿度。
(5)空根白心。症状：蘑菇柄内变成白色疏松的髓或中空。病因：气温超过18℃，如果喷水少，空气湿度在90%以下，菌盖表面蒸发量大，菌柄中缺水所致。
防治方法：通风降温。适时喷水，使粗土粒含水量达到20-22%。每采完一潮菇后喷一次水。
(6)薄皮早开伞。症状：蘑菇柄细、盖薄、提早开伞。病因：培养料过生、过薄、过于，出菇期遇高温、高湿，出菇密度大。
