苹果褐斑病一直是苹果种植区域最令人头疼的流行性病害。尤其是在7、8月份，高温多雨，非常有利于褐斑病的发生和流行，造成苹果提前大量落叶，严重削弱树势，影响苹果的产量和品质。这些年许多果农只是注重于药剂防治，诸如腈菌唑、戊唑醇、已唑醇等用量很大，但防效往往不理想。究其原因，还是忽视了综合防治。
苹果褐斑病属于流行性病害，菌原数量、环境条件和苹果本身的抗性，三个条件都达到时，病害就会迅速爆发。待病害开始流行爆发时，很难用药剂控制。因此，防治苹果褐斑病应该从减少病原菌数量、提高苹果自身抗性和合理用药三方面入手，综合控制病害的发生。
注重春季预防在合理施肥的同时，苹果开花前、落花后、套袋前喷酒杀菌剂减少病原菌数量。
平衡施肥提高苹果抗病能力7月份，苹果进入膨果期，根据苹果的大小及其生长量，追施含钾为主的复合肥，结合喷药叶面喷施含钙、锌、硼等中微量元素的营养型叶面肥。
及时修剪通风透光对于副稍生长较多、果园郁闭明显的果园，最好疏除影响光照的副稍或扭稍，以改善果园的通风透光条件。
交替、混配喷酒杀菌剂氟硅唑、戊唑醇、腈菌唑等唑类杀菌剂和多菌灵、溴菌清等杀菌剂交替或复配使用，7天一次，连喷2~3次。进入雨季就开始喷，尽量提前压制病菌的繁衍扩散。
注意喷药质量按产品使用说明兑药，用雾化好的喷雾器械以及喷头喷酒，喷药前先调试好喷头喷雾质量和机器转速产生的压力大小，从不同角度仔细喷酒雾化较好的药液，达到理想的喷药效果。
