由于鱼病的流行对渔业生产的威胁十分严重，故研究鱼病的病原、病因、发病机理和防治手段，以控制其流行，具有重要经济意义。鱼病的分类，常见的有三种分类方法。
一、按鱼类的生长阶段分类
1、苗病：指鱼卵、孵化过程中的仔鱼的疾病。
2、种病：指当年和隔年鱼种的各种疾病。
3、成鱼病：指成鱼和亲鱼的各种疾病。
二、按病灶或病变部位分类
1、皮肤病。指鱼类体表、皮肤、鳍条等的疾病。
2、鱼鳃病。专指鱼鳃及其附属器官的疾病。
3、消化道病。指鱼类消化系统及有关组织的疾病。
4、其他内脏病。泛指消化系统以外各个内部器官和组织的疾病，常冠以发病器官或组织的名称，如鳔炎、肾炎、白内障病等。
三、按病原体或病因分类
1、寄生性鱼病
系由病原生物寄生所致。可分为：传染性鱼病系由病毒、细菌、真菌、寄生藻类等植物性病原寄生而引起的疾病，又称微生物病。
侵袭性鱼病系由原生动物、蠕形动物、甲壳类等动物性病原寄生而引起的疾病，又称寄生虫病。
2、非寄生性鱼病
系由病原生物以外的各种因素所引起的疾病。敌害凶猛鱼类、两栖类、爬行类、鸟类和一些哺乳类，及一些水生无脊椎动物、低等藻类等，均能直接吞食或伤害鱼类及其苗种，统称为敌害。
其他包括由理化因素引起的泛池、中毒，因缺乏饵料或营养而引起的各种生理障碍，以及人为所引起的各种机械损伤等。
