韭菜入冬前先灌一次粪水，促进不休眠品种持续生长，又是休眠品种封冻前的封冻水，也为冬季生产打下了肥水基础。不休眠品种应早扣温室和夜间盖苫子，白天放风，保证白天室内气温不超过25℃，夜间不低于10℃。
当株高10厘米左右时培土。日光温室保湿性强，入冬前又灌了粪水，因此采收之前可不灌水不追肥，主要是保温防寒。严寒季节要盖纸被保温，因近底脚处温度最低，易受冻害，除了整棚盖纸被和草苫子外，在前坡底脚处应加盖草苫子或纸被，确保室内近底脚部分最低气温在5℃以上，韭菜才能正常生长。
日光温室内空气湿度大，气温又偏低，易发生灰霉病等病害，能给韭菜生产带来较大损失，应当综合防治，以防为主。一般严冬季节不敢放风，主要是怕降低室温。采取烟囱式放风，排湿效果好。晴天中午前后支起几个烟囱式放风筒，短时间放风，冷空气进入室内较少，是预防灰霉病的有效措施，又有利韭菜生长。
温室底脚附近夜间最低温保持5℃以上，能防止冻害，还能有利预防灰霉病。因一旦发生冻害，灰霉病菌就易从冻伤处侵入，没有冻伤病菌就难侵入。收割韭菜后及时清除残叶，能减少传染源。用药剂预防也有效，尽量不喷雾。因喷雾增加室内空气湿度，防治效果差。以烟剂熏烟和喷粉尘剂防治效果好。
冬茬韭菜主要靠鳞茎贮藏的营养物质生长，而且基肥充足又灌了封冻肥水，追肥不是主要栽培措施，主要靠喷洒氨、磷、钾叶肥补充营养物质。冬季日光温室韭菜耗水量不大，必要时可按行浇水，不能漫灌，防止明显降低土温。所以，冬季日光温室韭菜主要是保温和防病。
