菌糠因具有松软、气味芳香、适口性好、营养价值大幅度提高的优点，成为发展节粮型饲料来源的一个有益途径。但在生产中使用菌糠饲料应注意下列问题：
1、注意菌糠饲料的品质
菌糠饲料品质的好坏，关系到其利用价值的高低。在使用菌糠饲料时，应选择采收过3、4茬菌类、且菌丝生长旺盛，表面被覆一层白色菌丝体膜、无杂菌污染、子实体分化良好的菌糠。
凡菌丝体生长较差、尚有少部分培养料未生菌丝、串结不良，尤其是菌丝稀少、生长不良、杂菌污染严重，出现酸臭等异味的菌糠不要使用。
同时，收菌糠时要注意将发霉、发黑等污染部分的菌糠除掉，以防止霉菌引起动物中毒。
2、注意菌糠的适宜使用量
在饲料中加入菌糠的量，要根据菌糠的营养价值、饲养对象和其食用菌糠时间的长短而定。
菌糠的使用量的决定，需注意的是菌糠饲料只能用作替代日粮中的部分糠麸类饲料，不可替代蛋白质、能量饲料，否则会影响动物的生产性能；开始食用菌糠的牲畜，用量宜由少到多，让其有一定的适应过程。
一般菌糠的使用量，体重在20千克以下的仔猪，加入菌糠的量占饲料的10%-20%;体重在30千克以上的肥猪，加入菌糠的量占饲料的25%-35%;成年母猪，加入菌糠的量占饲料的25%-40%。
菌糠的营养成分受多种因素的影响，如栽培原料成分的差异、菌种的不同，培养环境的差别等，都引起菌糠成份的变化。
由于不同种类的菌糠营养价值的不同，因此对于不同的动物，其添加量也不相同。但无论用何种菌糠，在猪日粮种添加15%是可行的。
