五、防治虫病
有机稻米栽培，在防病防虫上要以农业措施和预防为主。首先要选用抗病品种，培育壮秧增强水稻自身的抗性。其次要根据病菌的浸染规律和害虫的发生规律，有针对性采取措施进行防治。
在防虫治虫方面，铲除其越冬场所和孳生地，利用昆虫的趋性进行诱杀、利用糖、酒、醋等诱杀某些趋化性鳞翅目昆虫的成虫。利用高压黑光灯诱杀某些趋光鳞翅目、鞘翅目的害虫。利用干草把引入夜盗虫产卵、集中灭卵。
此外利用高科技手段，搞雌蛾激素诱杀，利用天敌控制虫害发生，如赤眼蜂等。
六、有机水稻的收割和储藏
在收割和运输过程中，也要严格按照有机食品生产、加工、运输的环节要求进行。可以利用高科技以及自然方法，但绝不可以用化学类方法生产、加工、运输等。而且在生产、加工、运输等过程中也要严格注意自然环境的变化，严格避免空气、水、土壤、工具等沾染化学成分对稻米本身造成污染。
储藏入库之初要保证水库的安全水分达到14%~15%，在储藏过程中，定期检查水分和湿度变化，水分大，温度高，要及时晾晒，降水降温，要防止霉烂变质，及时防仓储虫害，以及避免化工类产品污染。
