由于有机肥料普遍欠缺，苹果园施肥主要依赖化肥。绝大多数园片有机肥投人不足，极少数园片的有机肥投入占到全年肥料投人总额的30%左右，好的园片也仅占到50%左右，绝大多数园片还是以氮磷钾复合肥为主。化肥具有养分含量高、肥效快等特点，但养分单纯，且不含有机物，肥效期短，长期单独使用，易使土壤板结，土质变坏。在化肥中，偏重使用氮肥，如尿素、碳酸氢铵等，过多的氮肥还影响苹果树对钙、钾的吸收，使树体营养失调，芽体不饱满，叶片大而薄，枝条不能及时停长，花芽形成难，果实着色差，风味淡且有异味，痘斑病、水心病普遍发生，贮藏性下降，表现出明显的缺钙症状。特别是红富士品种，对氮肥敏感，氮肥过多，苹果实品质明显下降。近年消费都强烈反映红富士等品质下降，不好吃，也不耐贮，其主要原因就是氮肥过多所致。过多使用氮肥不可使树体抗性降低，诱发腐烂病、白粉病等。欧洲专家在考察我国苹果园现状后认为，氮肥过多是造成产量、质量不高的主要原因之一。对此我们应引起高度重视。
果树的生长发育需要吸收多种营养元素，除了大量元素外， 微量元素也很重要，若缺乏则易患缺素症。同时， 各种元素间还存在着相助或拮抗作用。如苹果施氮肥后， 树体内含氮量增加的同时， 对镁的吸收也多; 反之当含氮量低时，对镁吸收减少。而氮与钾、硼、铜、锌、磷等元素间存在拮抗作用， 如过量施用氮肥， 而不相应地施用上述元素， 树体内的钾、硼、铜、锌、磷等元素含量就相应减少。相反地，对苹果施少量的氮肥，叶中的钾素含量增多，且土壤中氮含量越少，对钾肥吸收就越多，甚至导致因钾素过剩。磷肥施用过量，如不相应地增加钾、镁肥，则抑制对钾、镁的吸收，出现钾、镁不足。而钾素过多，对钙、镁吸收就减少; 相反地，低量钾肥可提高树体中钙、镁的含量。缺钙时，不利于氨离子吸收，过多，土壤呈偏碱性，使铁、锰、锌、硼等变为不溶性，导致缺素症的发生。然而在生产实际中，有些果农不注意或不了解肥料的平衡作用， 在施肥时往往以氮、磷为主，其他元素施用较少，导致缺素症的发生，产量不高，品质下降。要改变这种状况，就必须了解土壤种类、土壤中营养元素的丰缺、果树对不同养分的需求，最好进行测土配方施肥，以免果树缺素症的发生。
