目前，毛丝鼠的配种一般采用两种方法：一种是一公一母交配法，适合于初养者采用，即常年将一公一母合养在同一笼内，让其自由交配。这种配种方法，系谱清楚，仔兽的成活率高，但饲养成本高，容易出现母鼠空怀。另一种方法是一公多母法，即在选种的基础上，根据系谱、年龄、毛色、体形，一只公鼠搭配数只母鼠，但是必须采用通道式笼舍，同时给母鼠戴颈圈。这种一公多母的配种方法，能够充分发挥优良公鼠的作用，并能降低饲养成本。
毛丝鼠与其他毛皮动物比较，产仔数少，一般产仔1-4只，1-2只者占80%，产3只和4只者较少。
毛丝鼠初生仔鼠的发育情况
初生仔鼠睁眼，全身被有完整的被毛，门齿发达，后臼齿未长出，并能站立行走，5分钟后即能发出叫声，很快就能在母鼠周围跳跃。
当母鼠自身助产的牵拉力将仔鼠抛出几厘米远时，仔鼠能很快回到母鼠身旁或腹下，接受母鼠的护理。被毛干后即有吮乳能力。仔鼠吃到初乳的迟早，主要取决于仔鼠的生活力与母鼠的母性。发育正常，体重在40克以上的仔鼠，在母鼠的配合下，能很快找到乳头并吃到初乳。
初生仔鼠由于体温调节机能尚未发育健全，对环境温度的适应能力较差。因此环境温度对仔鼠的成活和生长发育有很大影响。当室温低于10c，胎毛迟迟不干，仔鼠的活力变弱，精神萎顿，眼半睁半闭，很难吃上初乳，这样的仔鼠在1-3小时内不会死亡，如果及时采取加温措施，大多数可恢复活力。
毛丝鼠的初生仔鼠体重为30-50克，30克以下者很难养活。仔鼠到10日龄时便开始吃细软的饲料，到45日龄时可以离开母鼠独立生活。