7、花鳗鲡的拟指环虫
拟指环虫在花鳗鲡养殖过程中较为常见，但感染率较欧洲鳗、美洲鳗低的多。主要寄生于鳗鱼鳃部，严重影响摄食，很容易导致烂鳃症。
拟指环虫抗逆性强，大部分驱虫药物使用几次后就没有明显效果，目前常用的鳗鱼驱拟指环虫药主要有：阿维菌素类、菊酯类、咪唑类、中草药类（苦碱、贯众、槟榔等）、氯硝柳胺、敌百虫等。
养殖场应备用多种指环虫类驱虫药，不要长期单用某种驱虫药，应搭配使用，同时定期预防驱虫是不错的选择。
8、花鳗鲡的小瓜虫病
小瓜虫主要寄生于鳗鱼体表、鳍条和鳃上，大量寄生时严重影响鳗鱼摄食。通常发生在水温较低的秋冬及春季，危害各类规格的花鳗，在土池中时有发生，精养池内常采用加温措施所以发病率相对较低。
一旦发病其传染率和死亡率相当高，很难治疗，若白苗培育阶段因加温力度不够、水温较低而不慎感染该虫，不及时处理其损失将非常严重。所以花鳗白苗培育时最好将温度维持在30℃左右，发生在幼、成鳗阶段时，生产上可采用杀虫醛或中药类驱虫剂（生姜、辣椒、苦参、苦碱等）进行治疗，有一定疗效。
9、固着类纤毛虫
主要包括杯体虫和累枝虫两种，水温在22一26℃时容易爆发，少量固着时一般危害不大，当水中有机质含量多，日换水量少时，该虫大量繁殖，导致鳗鱼摄食不良。
花鳗白苗培育阶段易感染杯体虫，在黑仔、幼成鳗期间易感染累枝虫，该类虫体常常寄生于鳗鱼口腔上下颚，肉眼可见口腔内较多黄色粘液，大量寄生时口腔充血发红，鳗鱼绝食，活力变弱。当鳗鱼长期不摄食时，除常规检查项目外还应注意病鳗口腔内部，若发现口腔较多黄色粘液或充血变红时应刮取粘液镜检，刮取时应细心，应使用载玻片用力刮取口腔内部，尤其是上下颚齿附近，必要时连同颚齿一同刮下镜检，如此才不至于漏诊误判。治疗时使用高锰酸钾、高碘酸钠、苯扎溴铵、硫酸铜或水体纤虫净（中草药提取素）。
