在玉米种子贮藏期间要搞好以下几个方面的检查与管理。
一、温度检查
种子入库完毕后的半个月内每3天检查1次，以后每隔7～10天检查1次。在种温10℃以下可适当减少检查次数。检查方法，种子堆每层设5处，分成上、中、下层。
二、水分检查
检查水分同样采用3层5点15处的方法，把每处所取的样品混匀后，测定。对部分有怀疑的样品，可以单独测定。一般在第一、第四季度各检查1次，第二、第三季度每月检查1次。
三、发芽率检查
种子发芽率一般每4个月检查1次，但在高温季节及药剂熏蒸后，都应相应增加1次。
四、虫、霉、鼠、雀检查
检测一般采用感官测定和筛检相结合的方法，结合查仓进行。并根据查仓的结果和检查结果，对仓库进行科学管理，预防种子发热、霉变和发芽率降低，要合理地采用通风措施。
通风是种子贮藏期间的一项重要管理措施，但是否可以通风应考虑仓库内外的温湿度情况：
一是遇雨天、刮大风、浓雾等天气，不宜通风。
二是当外界温、湿度均低于仓内时，可以通风。但应注意防止种堆内外温差过大而引起表层种子结露。
三是当仓内温、湿度与仓外其中之一项相同，而另一项仓外低于仓内时，可以通风。
四是当仓内温、湿度其中之一高于仓外，而另一项低于仓外时，这时应以空气的绝对湿度为指标，当仓外的绝对湿度低于仓内的绝对湿度时，可以通风；反之，不能通风。
