2、改善品质
施用微生物菌剂的农产品，蛋白质、糖分、维生素、氨基酸等有益成份含量明显提高，籽粒、果实丰满光滑，蔬菜果品色泽亮丽，既好吃又好看，价值还高。
3、提高化肥利用率
微生物菌剂有效菌大多能分解土壤中有机质，有机质分解过程中生成腐殖酸，腐殖酸与土壤中的氮形成腐殖酸铵，可减少氮肥的流失，提高钾、磷元素利用率，降低生产投入，减少资源浪费。
4、改善土壤养分
微生物菌剂有效菌所分泌胞外多糖物质，是土壤团粒结构的粘合剂，能够增强土壤团粒结构，疏松土壤，提高土壤通透性和保水保肥能力，增加土壤有机质，活化土壤中的潜在养分，改善土壤中养分的供应状况。
五、使用微生物菌剂的注意事项
1、避免高温干旱或雨天施用微生物菌剂，会影响有益菌的活性。
2、严禁将微生物菌剂和除草剂、杀虫剂以及杀菌剂等农药一起使用，如果一起施用了不仅会降低有益菌的活性，甚至还会将其杀死。
3、在果树种植中，微生物肥料不仅能当作基肥，还能作追肥使用。
