红豆杉的药用价值主要体它的提取物—次生代谢衍生物—紫杉醇，紫杉醇最早是从短叶红豆杉的树皮中分离出来的抗肿瘤活性成份。是治疗转移性卵巢癌和乳腺癌的最好药物之一，同时对肺癌、食道癌也有显着疗效，对肾炎及细小病毒炎症有明显抑制。
红豆杉的根、茎、叶都可以入药，可以治疗尿不畅、消除肿痛，糖尿病、女性月经不调、血量增加都有治疗作用，红豆杉也可以用于产后调理，对女性病症具有一定的治疗作用。
在园林绿化，室内盆景方面也具有十分广阔的发展前景，如利用珍稀红豆杉树制作的高档盆景。应用矮化技术处理的东北红豆杉盆景造型古朴典雅，枝叶紧凑而不密集，舒展而不松散，红茎、红枝、绿叶、红豆使其具有观茎、观枝、观叶、观果的多重观赏价值。
红豆杉能很好地净化室内的空气，吸收室内的毒气如新房装修时的甲醛都能很好地被吸收，而降低毒气在室内的含量。红豆杉本身能吸收二氧化碳，释放出氧气，是个白天晚上都可以用的天然的氧吧，属于cam类树种，可以预防呼吸道疾病，保持空气的清洁度和安全度。经现代环境监测证明，红豆杉对很多毒气比如二氧化硫、－氧化碳等都具有吸收进体内，净化室内空气的作用。
