4低温封闭保管
大豆种子含有的蛋白质很多，处于高温环境中很容易发生变性，所以一定要将种子贮藏在低温的环境条件中，还可以通过冬季低温环境或者是人工降温的方式给种子提供密闭贮藏的条件。大豆种子的贮藏温度要低于5℃，有利于保证种子的品质和发芽，粮堆降温放入仓库之后，要及时进行严密覆盖，可以用废旧麻袋和草席，这样不但可以保温，还能避免感染虫霉病菌，实现安全的贮藏。大豆种子的贮藏应该确保专仓专用，大豆种子不适合与化肥或者农药一同储藏，否则挥发性气体进入种胚以后，会导致大豆种子丧失活力。
5适时通风
通常大豆种子的含水量较高，所以应该采取合理的通风措施，可以达到降温散湿，安全贮藏种子的目标。同时还要注意堆、垛的高度，一般大豆的水分都是低于12%，而温度低于25℃，所以种子就不能堆放太高，适宜高度是袋装以8个标准麻袋高为准，最适宜的高度是和窗门平行，这样对于种子的通风降温有益处。如果温度或者是含水量其中任何一项高于以上的标准，那就要相应的降低堆放高度。合理安排垛与墙之间、垛与垛之间的距离，散堆适宜高度是1.5米，仓贮的适宜高度是仓高的1/3~1/2，含水量和堆高是成反比的。通风方式包括自然通风和机械通风两种。其中自然通风指的是将仓库的门窗都开启，保证空气可以自然对流，从而实现仓内降温散湿的目的。机械通风的速度比较快，而且效率也比较高，可是需要配备一套完整的机械设备。
6严格检疫
在大豆种子的贮藏阶段，主要会受到印度谷蛾与粉斑螟蛾的危害，而危害贮藏种子的微生物则主要是真曲霉菌和青霉菌。可以采取高低温杀虫、机械除虫以及化学药剂防治等方法对抗仓库中的虫害。具体的操作是将敌敌畏盛放在小碟子中，然后用报纸垫底放在粮面上面，保证多余72小时的加盖密封时间，这样可以达到100%的杀虫率。大批量的种子可以采取熏仓法消灭虫害。如果将仓库内的温度降低到8℃，而相对湿度控制低于65%、种子水分在13.5%以下的时候，可以抑制细菌滋生。
