移栽苗一般于秋末封冻前或春季萌发前起苗和移栽，在整平耙细的畦面上，按行距25cm开沟，株距10cm垂直栽入沟内，以根头埋人土下3cm为宜。栽后填土压实，及时补水。
四、黄芩病虫害防治
1.叶枯病
高温多雨时易发，为害叶片。发病初期，先从叶尖或叶缘出现不规则的黑褐色病斑，迅速蔓延，最后叶片枯死。防治方法：清除病残体，消灭越冬菌源。发病初期用1：1：120波尔多液或用50%多菌灵1000倍液喷雾。
2.根腐病
两年生以上的成株易发，为害根部。多于8-9月发生，个别枝根和须根变褐腐烂，蔓延至主根变黑、腐烂，全株枯死。防治方法：预防应注意中耕、翻晒土壤，雨季及时排水，忌重茬；发病初期用1%硫酸铜或石灰水在病穴消毒。
五、黄芩的采收加工
于秋后茎叶枯黄时，齐地面剪除地上茎叶。通常在直播田管理措施得力的情况下可在第2年秋或第3年早春刨挖；育苗移栽田在当年秋季或第2年春采挖，将根刨出时间需选择晴朗天气。
另外，刨挖时切忌挖断，要注意合理操作，采挖后去掉茎叶，修剪根茎抖净泥土，晾晒至三四成干时撞去粗皮，再完全晒干后即可入药。如果黄芩作为工厂提取黄芩苷的原料时可以不撞皮，直接晒干后出售。
在晾晒过程中避免因阳光太强、曝晒过度而发红。需要注意不能在采挖过程中接触雨水，否则根极容易变绿发黑，最终生药的质量会受影响。
