要想从根本上预防和防治食用菌病虫害，就需要控制和改善生态环境，采取必要的预防措施。本文就食用菌病虫害的防治原则进行简述，以期为生产实践提供参考依据。
一、选择合适的菌种
（1）要想选择合适的菌种，一定要到正规厂家去购买。
（2）母种传代不要过3代，栽培种必须是从原种转接过来的。
（3）一定要选择菌丝健壮、没有受过污染的优质菌种。
（4）品种一定要适合当地的情况。
二、进行科学的栽培管理
（1）不同品种合理轮作
实践结果提示，如果在同一个大棚里不断地栽培同一类型的菇类，则很容易造成杂菌污染情况。要想对食用菌主要病虫害进行预防，就要坚持不同品种之间合理轮作的原则。
（2）在大田里和其他作物一同轮作
部分菇类种植在大田里，不需要对其进行消毒，仅仅取表土下30厘米的土刨细，将石灰粉搅拌到其中就可以。每两三年就轮作一次，不但可以起到肥田的效果，而且可以对病虫害起到杀灭的作用，故值得推广和应用。
（3）定期更换大棚
要想起到比较理想的防杂效果，可以定期更换大棚。
三、建立和完善防治系统
（1）要找到病虫害传播的途径，加以切断。要想综合防治病虫害，就需要切断食用菌主要病虫害的传播途径。
（2）为了使病虫害的发生次数有所减少，需要对环境加以控制。
①使料温有所降低：如要想对胡桃肉状菌加以防治，可以将双孢菇发菌的料温控制在21℃以下。
②要想对空气进行消毒，改善闷湿环境，就需要定时通风换气。
③随时调整光线。为了满足不同品种的关照度需求，需要定时调节光线。
四、注意采取农艺防治措施
土壤不同，它们的微生物区系也是有所不同的。生态环境有所不同，生物群落也就有所不同。
比如，有的土棚栽培效果在第一年的时候都比较好，到了第二年效果就开始变差了，这就是因为土棚的生态环境越来越不理想了，不仅病菌变多了，虫害变多了，而且空气质量也变得越来越差。
因此，要想使病虫害的发生次数有所减少，就必须使生态环境得以改善，使出菇环境得以优化。
