五、病虫危害 病虫危害培养料后，影响食用菌菌丝正常生长，菇蕾不能形成，即便已形成的子实体也会萎缩死亡。一些潜伏在料里的菌蛆、线虫、菌螨等，可咬食菌丝及培养料，其排泄物使料变黏发臭，使食用菌丧失出菇能力。防治方法：保持菇房及周围环境卫生，认真做好消毒工作，杜绝病虫侵入，平时注意检查，一旦发现病虫害应立即进行防治，争取早发现、早防治，把病虫害消灭在初期。
菇蕾及幼菇死亡的原因及防治
一、温度过高 当菇蕾形成和生长时，菇棚（房）的温度突然升高或连续数天在20℃以上，再加上通气不良，菇蕾就会萎缩变黄，最后死亡。这种情况常发生在秋末或早春，因菇蕾在低温条件下形成，其营养是由菌丝向子实体运送，而当温度突然升高时，营养又由子实体倒流回菌丝体，菇蕾因得不到营养而死亡。防治方法：密切注意气温变化，根据天气预报调节好菇棚（房）的温度，使菇棚（房）温度保持在20℃以下，严防菇棚（房）温度突然升高。
二、菇棚（房）通气不良冬季，菇农为保持菇棚（房）温度，常将菇棚（房）关闭严密，而忽略通气。也可能由于菇棚（房）过大，周围虽有通气孔，但通气不均匀，菇棚（房）内外气体不能交换，菇棚（房）内供气不足，菇蕾或幼菇得不到充足的氧气而窒息死亡。防治方法：无论在什么情况下，都要注意菇棚（房）通气，每天通气1～2次，气温高时可在早上或晚上通气，气温低时可在中午前后通气，通气时间可适当短些。有风天，只开背风的通气孔，而无风的晴天，通气孔都开启，使空气充分流通。
三、用水不当 在幼菇生长期间，直接向菇床及菇体上喷水，使菇棚（房）内湿度过大，若菇棚（房）通气不良，使菇体上的积水不能及时散发，而在菇体表面形成水膜，被水渍死，或诱发细菌病害，使幼菇腐烂死亡。菌筒或覆土层缺水，幼菇得不到足够水分而枯死。也可能在菇棚（房）温度高时，直接向菇体喷水，菇蕾突然受刺激而死。防治方法：当菇棚（房）温度在20℃以上时，不能喷水。每次喷水时要注意通气，不喷闷水。在菇蕾或幼菇期不可直接将水喷在菇体及菇床上，应向地面及空间喷水，保持菇棚（房）适宜湿度。菌筒或覆土水分不足时，及时补水调湿。
